Gaita kültürü ,gaitada(dışkıda) barsak enfeksiyonuna bağlı bakteriyel kökenli bir enfeksiyon olup olmadığının araştırılması için yapılmaktadır.Normalde gaitada bir çok bakteri olduğundan kültürde daima üreme olur.Klinik olarak anlamlı olan ve tedavi edilmesi gereken ise gaita kültüründe patojen yani hastalık yapıcı bakterilerin üremesidir.

Gaita kültüründe Salmonella,Shigella,Vibrio gibi bakterilerin üremesi patojen yani hastalık yapan bakterilere örnek olarak gösterilebilir.